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研究新进展:H7N9向中国南方传播并演变成三个主分支
来源:damugemaoyi.com  阅读量:1666

没有人知道h7n9禽流感是否有可能在人群中轻易传播。h7n 9禽流感已经在中国造成560多人感染,204人死亡。然而,最大规模的家禽h7n9基因组调查提供了病毒进化和传播的更详细图像。

研究新进展:H7N9向中国南方传播并演变成三个主分支

h7n9于2013年3月底首次在上海及周边地区发现,同年4月病例数量开始飙升。在确认活禽市场是疾病向人类传播的主要途径后,最初的疫情迅速得到控制。尽管人们希望这种病毒会逐渐消失,但这一期望最终破灭了,h7n9在那个冬天再次卷土重来,蔓延到南方,引发了第二波大规模人类感染。2014年夏季没有新病例,证实了其季节性模式。去年年底,感染再次上升,第三波感染仍在继续。

来自几个省份活禽市场的样本

在本周的《自然》(自然)杂志上发表的一篇论文中,一个由中国科学家领导的国际研究小组描述了从2013年10月到2014年7月如何通过从中国东部5个省份15个城市的活禽市场采集拭子来追踪病毒。该研究平均在7个城市活禽市场和3%的样本中检测到h7n9病毒。

研究小组对438个病毒株的基因组进行了测序,发现随着病毒扩散到南方,它进化成三个主要分支,并有多个分支。

新发传染病国家重点实验室病毒学家关彝和深圳市第三人民医院朱化辰是本文的共同作者。

这种多样化是意料之中的,跟踪它有助于识别推动病毒传播的主要贸易路线和市场。关彝说:“目前还不清楚病毒在鸡体内传播了多远。我们的论文证实了这种病毒已经分裂成了一些地方谱系。中国东部仍然是病毒的储存地和“分发中心”

关彝指出,随着禽流感病毒在鸟类中的进化和多样化,一些基因变化可以改变它们的传染性、毒性或在人群中传播的能力。人类感染也为病毒提供了更好地适应宿主的机会。

因此,基因监测对于追踪突变和检测流感病毒株在哺乳动物(如雪貂和其他动物模型)中传播的能力是否增强极其重要。从疫情开始,h7n9携带的一些突变比h5n1禽流感更容易从鸟类传播到人类。自2003年出现以来,h5n1已在16个国家造成784例感染和429例死亡。

缺乏监测

目前h7n9感染的浪潮和研究小组追踪的第二波感染可能有不同的传播方式。在最新的研究更新之前,2014年只从鸟类中收集了8个基因组序列并储存在基因库中,而2013年只收集了258个序列。布鲁塞尔自由大学的禽流感流行病学家和生态学家马里乌斯吉尔伯特(Marius gilbert)表示,这不足以随时间推移在地理上绘制病毒分布图。

nature新闻团队分析了过去15年提交给genbank的所有禽流感亚型的测序基因组数量。结果表明,全球遗传检测仍然非常不利,而且速度不够快。大多数病毒在收集数月或数年后被测序。

关彝同意及时监控非常重要。然而,监控和病毒测试既昂贵又耗时,尤其是对病毒分离和测序而言。这意味着很难对动物体内的流感病毒进行常规监测,而这种监测通常只针对疫情。对于h7n9,测序病毒需要使用生物安全3级实验室的权利。鉴于这些复杂的因素,关彝认为最近储存在基因库中的h7n9序列的数量并不太少。

加上时间滞后,公共机构和研究人员对流感病毒株进行测序,有时只有在发表论文时才会公布数据。这项新研究的作者已经将序列发送给了genbank,并且之前已经与世界卫生组织(世卫组织)和其他机构共享了这些数据。

传播风险

h7n9不太可能很快消失。这种病毒现在在中国各地的家禽中普遍存在,散发性感染很可能会继续发生。研究人员警告说,“像以前的h5n1和h9n2流感病毒一样,家禽通过跨境贸易将病毒传播到中国境外似乎只是时间问题。”

关彝和他的合着者说,既然h7n9可以感染人类,它应该“被视为流行性病毒出现的主要候选者”关彝指出,鉴于流感病毒数量庞大,有必要将疾病控制和疫苗开发作为主要目标,h7n9应该列在首位。

目前没有太多潜在威胁。上个月,世卫组织警告说,新动物流感病毒的多样性和地理分布是“前所未有的”。新病毒的大杂烩已经在世界各地出现,包括h10n8、h5n2、h5n3、h5n6和h5n8。有证据表明,目前不同的亚型更容易、更快地交换基因,形成新的病毒株。关彝说“几乎不可能”评估日益增加的多样性是否代表了来自正在出现的大流行病毒的更大威胁。

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